学校设有研究生院、基础医学院、公共卫生学院、法医学院、（国际）护理学院、第一临床学院、第二临床学院、第三临床学院、第四临床学院、口腔医学院、药学院、临床医药学院（独立学院）、高等职业技术学院（附设中等卫生学校）、网络教育学院、成人教育学院、医学信息学系、医学影像学系、眼科学系、医学检验学系、运动医学系、病理学系、医学心理与精神卫生系、生物科学与生物技术系、生物医学工程系、人文社会科学部、理工学部、实验动物部等27个院、系、部。