2016年，香港特别行政区有12所高校在内地招生，分别为：香港中文大学、香港城市学院、香港大学、香港理工大学、香港科技大学、香港浸会大学、香港教育学院、香港树仁大学、香港公开大学、珠海学院、香港岭南大学、香港演艺学院。澳门特别行政区有6所高校在内地招生，分别为：澳门大学、澳门理工学院、旅游学院、澳门科技大学、澳门城市大学和澳门镜湖护理学院。除香港中文大学和香港城市大学两所高校纳入统招范围外，其余港澳地区高校在内地均实行自主招生。
报考香港中文大学和香港城市大学的考生，须参加北京市组织的高招志愿填报，填报在本科提前批次A段。被这两所香港高校录取的考生，不能再参加其他批次的录取。没被这两所香港高校录取的考生，仍可参加其他批次的录取。其他港澳地区高校在内地实行自主招生，这些院校的招生工作安排在我市本科提前批次录取开始之前进行。凡被香港地区自主招生院校录取的考生，不能再参加其他批次的录取。而考生是否被澳门地区自主招生的高校录取，均不影响其被内地高校录取。
考生拟报考在内地实行自主招生的港澳地区高校，须通过招生院校的网站进行报名申请。目前，各院校2016年招生的报名申请均已启动，大部分高校的报名申请截止时间为6月中下旬，个别学校截止到7月初。
在内地实行自主招生的香港高校，一般还会组织面试，时间安排在6月底7月初进行。这些学校录取时除了依据考生高考成绩外，还依据学生的面试成绩。香港科技大学负责内地招生有关老师介绍，香港科大看重考生心理素质、逻辑思维和分析、应对与沟通能力等综合素质。面试以英语进行，内容没有特定范围，从时事、生活到个人兴趣都有可能涉及。面试时，考生阐述理念观点立场要言之有物、条理清晰、有逻辑性。在小组讨论的互动中，考生要展现自己、尊重他人。香港浸会大学面试也以英语进行，部分专业如中医学及生物医学等辅以普通话进行。面试形式包括个人面谈或小组讨论，主要评核考生的英语能力、个人素质及各方面的综合能力，包括沟通能力、表达能力、组织能力、批判思维、解难技巧等。
据不完全统计，目前8所已公布招生计划的香港高校在内地计划招生约1200人。其中，香港大学在内地计划招生不超过300人，香港科技大学计划招生 150人，香港浸会大学计划招生190人，香港树仁大学计划招生50人，这些学校面向全国招生，各省市不设名额上限。而在统招招生的香港城市大学，内地全国招生计划为208人，其中北京17人，香港中文大学全国计划招300人，其中北京17人。大部分香港高校要求考生高考成绩要达到本科第一批重点录取分数线，但香港树仁大学等个别院校要求考生高考成绩只需达到二本线。
从往年录取情况看，虽然一些香港高校在招生简章中只要求考生高考成绩达到当地一本线，但实际情况是，不少港校录取分高出当地一本线一百分左右。
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