目前，大部分高校2013年自主招生政策还未公布，但不少考生和家长非常关心如何选择报考自主招生高校的问题。有关专家建议，考生选择自主招生院校的关键要定准位，结合自身实力和特长量力而行，选择适合自己的高校。 据了解，2001年，教育部最早在东南大学等江苏省3所高校试行“自主招生录取”改革，至今试点高校约90所。这些试行自主招生的高校中，既有清华、北大这样在京综合性知名大学，也有浙江大学、厦门大学等京外重点高校;既有北京交通大学、北京林业大学等具有行业特色重点高校，也有一些市属高校。但是，根据往年的情况来看，有些考生和家长存在盲目申请多所学校，少则六七所，多则十几所，只要符合条件的都想试试的问题。但实际情况是，这种做法不但没有取得很好的效果，反而使孩子身心俱疲，影响了孩子的学习成绩。此外，一些高校对参加自主招生的考生报考时还有专业要求。考生要结合个人兴趣和爱好，根据招生院校要求，科学报考。
北京大学附属中学老师白瑞介绍，考生选择自主招生学校时，一定要结合自身的实力、特长，千万不要盲目申请。考生不宜选择太多学校，如果报考高校多，难免牵扯很多精力，影响正常的复习备考。考生就算获得自主招生的优惠条件，最后录取还要看高考成绩。因此，考生在申请自主招生学校时要科学选择，并要把主要精力放在正常的备考复习上。对于综合成绩并非顶尖，但在某一学科领域有特长或潜质的考生，不妨考虑一些有行业特色的高校，争取选择其在国内居于领先地位的学科。但是，参与自主招生的高校门槛都不会很低，题目难度也不会因为非“北大系”、“清华系”而有所下降。
包括北京交通大学等多所高校的招办负责人一致认为，考生报考自主招生选择两三所学校比较合适，并拉开梯度。一所是想冲的学校，即如果考生获得自主招生资格后，通过后期努力以及加分优惠，有机会考入的高校;一所是正常水平够得着的学校，考生可以选择自己喜欢的优势专业;三是凭借自己的实力比较有把握考取的高校，万一自己高考发挥失常也有机会被录取。
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